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DFG project G:(GEPRIS)441884911

SPP 2311: Robuste Kopplung kontinuumsbiomechanischer in silico Modelle für aktive biologische Systeme als Vorstufe klinischer Applikationen - Co-Design von Modellierung, Numerik und Nutzbarkeit

CoordinatorProfessor Dr.-Ing. Tim Ricken
Grant period2021 -
Funding bodyDeutsche Forschungsgemeinschaft
 DFG
IdentifierG:(GEPRIS)441884911

Note: Dies ist das zentrale Koordinationsprojekt zur Unterstützung der zweiten Förderphase des SPPs 2311 zum Thema "Robuste Kopplung von kontinuumsbiomechanischen In-silico-Modellen zur Erstellung aktiver biologischer Systemmodelle für den späteren Einsatz in klinischen Anwendungen - Co-Design von Modellierung, Numerik und Usability". Die Motivation des SPPs ergibt sich aus der Erkenntnis, dass trotz jüngster Fortschritte in der Biomechanik das Potenzial für medizinische Anwendungen noch nicht voll ausgeschöpft werden konnte. Einer der Gründe dafür sind die noch unzureichend entwickelten Schnittstellen zwischen Modellierung, Numerik und klinischer Anwendung. Hier setzt das SPP mit einem iterativen Co- Design-Ansatz zur biomechanischen Modellentwicklung an. Ziel ist es, nachhaltige Entwicklungskonzepte mit Blueprint-Charakter zu entwickeln. Die Herausforderung ist die hohe Komplexität aktiver biologischer Systeme; daher erfordern Multiskalen-Systemmodelle eine enge Zusammenarbeit zwischen Medizin, Ingenieurwissenschaften, numerischer Mathematik (Numerik) und Informatik. Insbesondere die Beschreibung von multiskaligen Systemmodellen erfordert innovative Kopplungsstrategien, die moderne Computerarchitekturen, neue und robuste numerische Methoden, Datenstrukturen und Integrationsfähigkeiten einbeziehen. Darüber hinaus müssen die Simulationsergebnisse für den Transfer in die Klinik und für die Anwendung auf klinische Fragestellungen in gemeinsamer Arbeit mit Medizinern aufbereitet werden. In der ersten Förderperiode wurden bereits richtungsweisende Erfolge bei der Entwicklung von gekoppelten Multiskalenmodellen mit robusten Kopplungsmethoden und -strategien erzielt. Beispiele sind ganzheitliche in silico-Modelle für den Skelettmuskel, das Herz und die Leber. Die Anbindung an die Numerik und die Nutzbarkeit bleibt jedoch eine Herausforderung. Welche Daten zur Parametrisierung und Individualisierung stehen beispielsweise in der klinischen Praxis zur Verfügung, welche numerischen Lösungsalgorithmen sind stabil und effizient genug, um von klinischen Anwendern akzeptiert und fehlerfrei eingesetzt zu werden, oder wie können die bereits entwickelten Methoden auf andere Anwendungsszenarien übertragen werden? Fragen wie diese sollen in der zweiten Förderperiode beantwortet werden. Der Fokus dieses Schwerpunktprogramms liegt auf der Modellierung aktiver biologischer Systeme im menschlichen Organismus, die klinische Integration und die Definition der Schnittstellen zwischen Modell und klinischer Anwendung; der Transfer der Modelle in die Klinik über klinische Studien ist jedoch nicht das Ziel des SPPs. Das Programm wird sich insbesondere auf Kopplungsstrategien für "aktive" biologische Systeme konzentrieren. Die Definition von "aktiv" bezieht sich auf Systeme, die aufgrund physikalischer, chemischer und/oder biologischer Phänomene oder Stimuli eine Zustandsänderung erfahren. Beispiele hierfür sind Stoffwechselprozesse, Wachstum/Umbau oder elektrische Stimulation.
   

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In-silico analysis of hemodynamic indicators in idealized stented coronary arteries for varying stent indentation
Computer methods in biomechanics and biomedical engineering 29(1), 167-188 () [10.1080/10255842.2024.2382819]  GO OpenAccess  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Histo-LOOP: A Novel Embedding Tool for Standardizing, Simplifying, and Advancing Histological Tissue Preparation
Journal of histochemistry & cytochemistry 73(3/4), 97-107 () [10.1369/00221554251329978]  GO OpenAccess BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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A computational model of coronary arteries with in-stent restenosis coupling hemodynamics and pharmacokinetics with growth mechanics
Scientific reports 15(1), 39229 () [10.1038/s41598-025-22291-w]  GO OpenAccess  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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A comprehensive framework for computational modeling of growth and remodeling in tissue-engineered soft collagenous materials
Biomechanics and modeling in mechanobiology 24(5), 1687-1711 () [10.1007/s10237-025-01988-x]  GO OpenAccess  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;
A relaxation approach to the coupling of a two-phase fluid with a linear-elastic solid
Applied mathematics and computation 504, 129503 () [10.1016/j.amc.2025.129503]  GO OpenAccess  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;
Automated model discovery for tensional homeostasis: Constitutive machine learning in growth and remodeling
Computers in biology and medicine 186, 109691 () [10.1016/j.compbiomed.2025.109691]  GO OpenAccess  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
A continuum chemo‐mechano‐biological model for in‐stent restenosis with consideration of hemodynamic effects
GAMM-Mitteilungen 48(1), e202370008 () [10.1002/gamm.202370008]  GO OpenAccess  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article/Contribution to a conference proceedings
Influx ratio preserving coupling conditions for the networked Lighthill–Whitham–Richards model
94. Annual Meeting of the International Association of Applied Mathematics and Mechanics (GAMM), GAMM 2024, MagdeburgMagdeburg, Germany, 18 Mar 2024 - 22 Mar 20242024-03-182024-03-22 Proceedings in applied mathematics and mechanics : PAMM 24(4), e202400197 () [10.1002/pamm.202400197] special issue: "Special Issue: 94th Annual Meeting of the International Association of Applied Mathematics and Mechanics (GAMM) / Issue Edited by: H. Altenbach, P. Benner, C. Böhm, C. Daniel, S. Glas, J. Heiland, D. Juhre, T. Richter, J. Saak, M. Schmidtchen, J. Waimann, E. Woschke, M. Kaliske"  GO OpenAccess  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;
Data-driven reduced order surrogate modeling for coronary in-stent restenosis
Computer methods and programs in biomedicine 257, 108466 () [10.1016/j.cmpb.2024.108466]  GO OpenAccess  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article/Contribution to a conference proceedings  ;  ;
Fast simulation of coronary in‐stent restenosis: A non‐intrusive data‐driven reduced order surrogate model
94. Annual Meeting of the International Association of Applied Mathematics and Mechanics (GAMM), GAMM 2024, MagdeburgMagdeburg, Germany, 18 Mar 2024 - 22 Mar 20242024-03-182024-03-22 Proceedings in applied mathematics and mechanics : PAMM 24(4), e202400067 () [10.1002/pamm.202400067] special issue: "Special Issue: 94th Annual Meeting of the International Association of Applied Mathematics and Mechanics (GAMM) / Issue Edited by: H. Altenbach, P. Benner, C. Böhm, C. Daniel, S. Glas, J. Heiland, D. Juhre, T. Richter, J. Saak, M. Schmidtchen, J. Waimann, E. Woschke, M. Kaliske"  GO OpenAccess  Download fulltext Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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 Record created 2022-12-29, last modified 2024-11-27



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